O Musa é administrado por uma associação civil, laica, sem fins lucrativos, e está
sob a coordenação de um Conselho de Administração composto de membros natos
e membros eleitos pelos associados. O Conselho de Administração é responsável
por indicar a diretoria do museu.

Conselho de Administração – quadriênio 2018-2022

Alfredo Wagner Berno de Almeida – Sociedade Brasileira para o Progresso da Ciência – SBPC
Bernardo M. de Paula – ManausCult
Celdo Braga – Conselho Municipal de Cultura
Dyson Teles – Universidade Federal do Amazonas – UFAM
Efrem Jorge Gondim Ferreira – Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia – INPA
Helder L. Queiroz – Instituto Mamirauá
Ingo Wahnfried – Universidade Federal do Amazonas – UFAM
Jair Maia – Presidente
Lúcia H van Velthem – Museu Paraense Emilio Goeldi – MPEG
Marcio Silva de Lira – Secretário
Maria Paula Mourão – Universidade do Estado do Amazonas – UEA
Orsine Oliveira Junior – AmazonasTur
Urias Sergio de Freitas – Associação Comercial do Amazonas – ACA
Wilson Luiz B. Périco – Centro da Indústria do Estado do Amazonas – CIEAM